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Agent pathogène Guide de lecture
Descriptif de l'agent pathogène
Coronavirus
© Copyright Institut Pasteur
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Nom
Coronavirus MERS-CoV (Middle East respiratory syndrome coronavirus). -
Synonyme
- HCoV-EMC (Human Coronavirus - Erasmus Medical Center).
NCoV (Novel Coronavirus).
- HCoV-EMC (Human Coronavirus - Erasmus Medical Center).
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Type
Virus -
Groupes de classement
- 3
Virus enveloppé, à ARN simple brin. Classé dans la famille des Coronaviridae, genre bêta-coronavirus, souche C. Deux clades, A et B, sont identifiées.
Les coronavirus font partie d'une large famille incluant des virus responsables de simples rhumes mais aussi, plus connus, les virus SARS-CoV (épidémie de "pneumonie atypique" ayant causé la mort de 800 personnes dans le monde en 2013) et le virus SARS-CoV2 responsable de la pandémie COVID-19 ayant débuté en 2020. Le MERS-CoV est une souche particulière identifiée pour la première fois chez l'homme, en 2012 en Arabie Saoudite.
Seul le Coronavirus MERS-CoV sera traité ici.
Réservoir et principales sources d'infection
Réservoir
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Type(s)
- Animal
- Homme
Ce virus zoonotique a pour réservoir les camélidés dans la péninsule arabique et en Afrique. La séroprévalence atteint 80 % des animaux adultes dans la péninsule arabique et dans le Nord-Est de l’Afrique démontrant une circulation endémique ancienne et persistante. Les analyses rétrospectives retrouvent des anticorps dans des serums des années 1990. Les humains sont infectés à partir de ce réservoir ou éventuellement au contact de patients infectés (1).
Principales sources d'infection
- Dromadaires : sécrétions respiratoires, pelage, lait, viande.
- Hommes : Sécrétions des voies aériennes supérieures et inférieures des patients. Le virus peut éventuellement être retrouvé également dans le sang, les urines, les selles, les vomissements et la salive.
Vecteur(s)
Viabilité et infectiosité
Viabilité, résistance physico-chimique
Le MERS-CoV peut persister dans l'environnement pendant 24 à 48 heures dans des conditions de température et d'humidité relative (HR) comprises entre 20 °C et 30 °C et 30 % et 80 %, respectivement. La viabilité du MERS-CoV en aérosol à 20 °C et 40 % d'HR diminue légèrement de 7 %, mais a été démontrée chuter de 89 % à 70 % d'HR. De plus, le virus est stable dans le lait de chameau jusqu'à 72 heures à 4 °C, mais les titres viraux perdent rapidement leur infectivité lorsqu'ils sont stockés à 22 °C pendant 48 heures (2).
Il est totalement inactivé par une exposition d’au moins 1 h à 56°C.
Le MERS-CoV est sensible à l'hypochlorite de sodium à 0,05 %, aux composés organochlorés à 0,1 %, aux iodophores à 10 %, à l'éthanol à 70 % et au glutaraldéhyde à 2 %, au formaldéhyde et au peroxyde d’hydrogène (3).